Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx1Q9WV80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms