Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn5Q9WU28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms