Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkraQ9WTX2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms