Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms