Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabrg1Q9R0Y8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms