Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms