Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Opn4Q9QXZ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Opn4Q9QXZ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Opn4Q9QXZ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Opn4Q9QXZ9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Opn4Q9QXZ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Opn4Q9QXZ9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Opn4Q9QXZ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Opn4Q9QXZ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn4Q9QXZ9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Opn4Q9QXZ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Opn4Q9QXZ9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Opn4Q9QXZ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Opn4Q9QXZ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms