Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms