Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChmQ9QXG2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChmQ9QXG2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms