Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mid2Q9QUS6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms