Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp2Q9JLK4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp2Q9JLK4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms