Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bco1Q9JJS6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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