Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efcc1Q9JJF6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efcc1Q9JJF6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms