Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ssna1Q9JJ94 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ssna1Q9JJ94 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ssna1Q9JJ94 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ssna1Q9JJ94 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ssna1Q9JJ94 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ssna1Q9JJ94 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssna1Q9JJ94 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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