Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2ird1Q9JI57 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms