Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI08

Bin3, Bridging integrator 3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bin3Q9JI08 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bin3Q9JI08 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Bin3Q9JI08 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bin3Q9JI08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bin3Q9JI08 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bin3Q9JI08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bin3Q9JI08 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bin3Q9JI08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bin3Q9JI08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bin3Q9JI08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms