Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgap1Q9EPJ9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgap1Q9EPJ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgap1Q9EPJ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms