Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufa8Q9DCJ5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms