Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xab2Q9DCD2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms