Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne8Q9DC53 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne8Q9DC53 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms