Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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