Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SlirpQ9D8T7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms