Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rexo2Q9D8S4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms