Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc8Q9D753 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc8Q9D753 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc8Q9D753 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms