Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb8Q9D6J5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb8Q9D6J5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms