Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necab3Q9D6J4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Necab3Q9D6J4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms