Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms