Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms