Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lpcat2bQ9D5U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms