Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam227bQ9D518 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam227bQ9D518 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms