Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pramef12Q9D2F1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms