Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms