Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl52Q9D0Y8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl52Q9D0Y8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl52Q9D0Y8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl52Q9D0Y8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl52Q9D0Y8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms