Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms