Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cnih4Q9CX13 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cnih4Q9CX13 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cnih4Q9CX13 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cnih4Q9CX13 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cnih4Q9CX13 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cnih4Q9CX13 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cnih4Q9CX13 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih4Q9CX13 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cnih4Q9CX13 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih4Q9CX13 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms