Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms