Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MINDY3Q9CV28 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MINDY3Q9CV28 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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