Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsenenQ9CQR7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PsenenQ9CQR7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms