Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chchd5Q9CQP3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms