Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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