Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQF4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQF4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms