Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsmce3Q9CPR8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nsmce3Q9CPR8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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