Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim3Q99PE5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms