Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms