Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms