Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Csmd1Q923L3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csmd1Q923L3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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