Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms