Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NifkQ91VE6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms