Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt25Q8VCW2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms