Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf3Q8R3J4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms